病例：发热、腹痛，mNGS确诊胃肠道马尔尼菲篮状菌感染

患者，男，33岁，生于中国沈阳。

自2019年7月15日起，持续发热1月，随后腹痛（abdominal pain）20天。

患者被确诊HIV感染，CD4+ T细胞 7 cells/μL。

查体：腹部压痛和反跳痛（rebound pain）。

辅助检查：

血常规：WBC和PLT正常，轻度贫血（mild anemia）。

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由于获得的骨髓样本不足，未进行骨髓培养。

治疗经过：

T-SPOT阴性，但对于这类腹膜炎明显的患者，入院第4天给予异烟肼、利福平、乙胺丁醇、吡嗪酰胺（isoniazid，rifampin，ethambutol，pyrazinamide）经验性抗结核治疗。

为了识别特定的真菌种类，特别是区分马尔尼菲篮状菌组织胞浆菌（histoplasma)以及其他深部真菌感染。

FFPE样本送往华大基因技术公司进行宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing，mNGS)， 3天后发现(图)。

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何为Magure FFPE DNA LQ Kit？

来源：http://www.mgenbio.com/uploadfile/2019/1118/20191118054241148.pdf

何为FFPE？

FFPE (formalin fixation and paraffin embedding)是福尔马林固定、石蜡包埋的样本，是医学领域常见的生物材料。

将组织在 4–10% 的福尔马林中迅速固定。固定时间限制在 14–24 小时 (越长的固定时间将越容易导致DNA的片段化，对下游实验不利)。将固定组织彻底脱水 (彻底脱去福尔马林残余，因为其阻碍蛋白酶K的作用)。

纯化DNA时，使用新鲜从石蜡块上切下的组织，每次制备最大量：每片10 μm. 最多 8 片, 每片大约 250 mm2, 如果对样品总量和产量没有把握，建议用2-3 片样品进行一次预实验。

来源：https://www.biomart.cn/experiment/430/478/485/27106.htm

内镜止血治疗后，病变周围注入1：1肾上腺素，出血暂时停止。

马尔尼菲篮状菌

篮状菌病（Talaromycosis ）曾被称为青霉菌病 （Penicilliosis），是由马尔尼菲篮状菌 （Talaromyces marneffei，TM）感染引起的一种侵袭性真菌病，国内习惯称之为马尔尼菲篮状菌病或马尔尼菲青霉菌病。

TM核苷酸序列，

TM

TM

+

TM

TM感染引起的结肠受累患病率仅为1.9%本病例在内共有14例患者因TM感染而明显受累腹部(表1)。

主要肉眼病理改变为多发性胃肠道溃疡和肠系膜淋巴结炎。

野生竹鼠的TM感染率为100%。

值得注意的是，竹鼠是一种常见的啮齿类动物，在中国南方被饲养来获取肉和羊毛。

由于广东大部分TM感染患者没有接触过竹鼠，因此竹鼠传播病原体的可能性尚不清楚。

虽然患者的竹鼠进食史很有启发意义，但本病例竹鼠进食史与主要胃肠道表现之间的联系需要进一步研究。

参考文献：【上下滑动查看更多】

1.Zhou Y, Liu Y, Wen Y. Gastrointestinal manifestations of Talaromyces marneffei infection in an HIV-infected patient rapidly verified by metagenomic next-generation sequencing: a case report. BMC Infect Dis. 2021 Apr 21;21(1):376. 

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